有些人的性别认同，和生理性别是不一样的，这样的人就是所谓的跨性别。其中性别认同是女性的是跨女（trans woman），性别认同是男性的就是跨男（trans man）。

也有些人对跨性别和同性恋有所混淆，认为一个男生表现得「娘娘腔」、女生像个「男人婆」，是为了要吸引同性。实际上，一个人的性倾向（sexual orientation），也就是受到哪些性别的吸引，与他/她的性别认同是独立的两回事。相关不等于因果是统计学上的重要观念，只因为大多数的男人都爱女人，并不代表所有性别认同是男性的人，都会对女性感到兴趣。所以跨性别者可能是同性恋、异性恋或双性恋，两者不互相冲突。

再者，性别认同与性别表现也没有绝对的因果关系。女同志中的T，尽管打扮得阳刚（偏男性的性别表现），但依然认为自己是女生（偏女性的性别认同），所以与跨男是不同的。同理，一个男生爱穿女装，也并不代表他一定是跨女。

跨性别者往往承受着与性别认同相异的，别人对他们的期待、刻板印象以至于法律规定等等。这些才是性别不安症的根本成因啊！他们寻求解决方式的过程（也就是上述的「跨越」）看似简单，实际上是相当漫长而充满压力的。一来，许多跨性别者性别表现与生理性别相异，容易让不习惯的人感到不自然而有所排斥；二来《全面进化》有云：「人因无知而恐惧」，早期对跨性别教育的缺乏、不准确的刻板印象，加上多数人对少数人的心理优越感，造成了许多人对跨性别者的不了解或误解，以至于歧视与仇恨。

其实，跨性别者在智能、社交和生活能力上与非跨性别者并没有显著的差异。许多跨性别者低学历、没有好工作、从事特种行业…等等现象或刻板印象，主要是家庭、学校、职场与社会上的歧视与压迫，以及自我心理压抑造成其它心理障碍等原因间接造成的。

而且跨性别比许多人想象中的常见，可说就在你我身边。根据估计，跨性别的比例从0.3%（美国成人）、0.5%（美国麻州成人）、0.8-1.1%（荷兰学者Kuyper研究）到1.2%（纽西兰高中生），总而言之就是百分之一左右，与统一发票中奖机率相若，而且比四叶幸运草的机率还高上两个数量级呢！小编的Facebook好友有一千六百人出头，其中认识的跨性别者恰巧有16位，看来这数据有一定的可信度。

在《丹麦女孩》的年代，人们对跨性别了解甚少，因此经常把这些人当作精神分裂或其它精神疾病。事实上，跨性别本身并不是病；但假如因为性别认同和生理性别（或外界依照你的生理性别，对你的性别期待）不同，而造成烦躁、忧郁、痛苦、不安等负面情绪，在精神学中另称为「性别不安」（gender dysphoria、GD）[注三]。

心理学家一般认为性别认同在三岁时已经根深蒂固；而且迄今为止，并没有可信科学研究显示，把性别认同「矫正」成与生理性别相同的心理治疗有任何实质效果。这些心理治疗对跨性别者造成的伤害反而远大于帮助。反之，改变外在比改变大脑还要有建设性：许多跨性别者往往希望或尝试让自己的性别表现（gender expression）–也就是你的穿著、行为、举止等等，符合自己的性别认同，也就是–我觉得自己是女生，就会穿女装，反之亦然。

有些跨性别者还会以医疗方法改变身体，例如贺尔蒙取代疗法（hormone replacement therapy）–服用或施打符合性别认同的性荷尔蒙，以改变身体的性征；或者更进一步进行性别重置手术（sex reassignmentsurgery），也就是俗称的「变性」。这些种种通称为跨越（transition）的动作，都是为了让生理上或外表上的性别，与心理上性别认同更相似或符合。