胚胎因素是决定移植成功与否的重要因素。染色体数目或结构异常，基因异常以及胚胎发育潜能等均是影响胚胎质量的重要因素。胚胎的质量评估显得尤为重要。

目前，对胚胎的质量评估主要采用胚胎形态学评分。卵裂期胚胎通过胚胎细胞的数目、细胞的大小均匀程度以及胚胎碎片严重程度等综合评估。而囊胚期的胚胎主要通过内细胞团、滋养层及整个胚胎的情况等进行综合评估。长期的临床观察表明，这些形态学指标能反映胚胎的优劣，并且方便实用，因此，在临床上的应用最为广泛。高评分的胚胎，其种植率更高。

由于囊胚是经过进一步筛选的胚胎，移植的种植成功率更高，因此，多次卵裂期移植不能成功者，若能获得一定数目的胚胎，可通过囊胚培养、囊胚移植提高种植成功率。

但胚胎的形态不能直观反映胚胎的染色体和基因等重要因素，不能全面反映胚胎的发育潜能。因此，即使形态学上的优质胚胎也未必保证一定可以成功妊娠。

肥沃的土地在胚胎种植过程中起着重要的作用。

内膜的厚度是目前临床上常用的评估内膜质量的指标之一。若内膜厚度＞7-8mm，内膜有丰富的血流信号，说明内膜的质量较好，有利于胚胎的种植。若内膜较薄，需要通过口服雌激素等提高内膜的厚度，使其更符合胚胎种植所需。值得一提的是，目前尚无询证医学证据表明单纯性的子宫内膜过厚会影响胚胎的着床能力。对于单纯内膜偏厚的患者，请不必过分担忧。

子宫内膜息肉和宫腔粘连也是导致胚胎反复种植失败的原因之一。因此，对反复种植失败者进行宫腔镜检查是非常必要的。宫腔镜检查能发现子宫内膜息肉、宫腔粘连，评估其病情的严重程度，同时能切除内膜息肉，分离宫腔粘连。

内分泌因素包括甲状腺功能异常、高泌乳素血症等。

甲状腺功能异常，包括甲状腺功能减退、甲状腺功能亢进、甲状腺相关抗体活性异常升高升高等，均不利于胚胎种植。因此，对反复种植失败者，需常规筛查甲状腺功能，及时发现异常、及时治疗。 高泌乳素血症也是胚胎种植失败的潜在原因之一，口服溴隐亭可治疗高泌乳素血症。

抗磷脂抗体综合征、凝血因子异常等易导致局部微血栓形成，子宫内膜局部供血不足，不利于胚胎成功种植。口服阿司匹林、注射低分子肝素等可能有利于防止局部微血栓形成，提高胚胎种植率。

胚胎种植过程中，母体的免疫功能异常，如自然杀伤细胞的活性异常升高，局部免疫抗体分泌异常等，可能与反复种植失败有关。可通过输注高剂量的免疫球蛋白或丈夫淋巴细胞注射可一定程度提高临床妊娠率。但新近的大样本研究表明：但这些方法的实际作用尚待进一步确证。